1984年，南京农学院更名为南京农业大学。1996年进入“211工程”建设行列，开启了向高水平研究型大学的战略转型。2000年，学校由农业部独立建制划转教育部，并获教育部批准建立研究生院。2008年，南京农业大学入选为教育部教育援外基地。2009年，教育部与农业部共建南京农业大学。2014年，学校入选国家卓越农林人才教育培养计划。2017年9月，学校入选为“双一流”建设高校。2019年8月，入选教育部全国创新创业典型经验高校。

2020年7月，入选第二批高校国家知识产权信息服务中心建设名单。10月，被国家知识产权局、教育部确定为2020年度国家知识产权试点高校。11月6日，倡议发起的“全国农科研究生志愿服务联盟”成立。

2021年5月15日，成为高等农林院校课程思政联盟理事会员单位。

2022年2月14日，入选教育部公布的第二轮“双一流”建设高校及建设学科名单。 2022年11月24日，南京农业大学大方生物产业研究院在泰州医药高新区（高港区）揭牌。11月27日，生物育种钟山实验室在南京揭牌，中国工程院院士、南京农业大学万建民教授受聘为钟山实验室主任。南京市、江苏省农业科学院、南京农业大学、扬州大学签署共建生物育种钟山实验室协议。

2023年7月17日，学校倡导发起的亚洲农业科教创新联盟在海南三亚成立，联盟秘书处将设在南京农业大学。2024年1月7日，学校馆藏珍贵古籍《齐民要术》（明嘉靖三年马纪刻本）复制本8册被中国国家版本馆永久收藏。2024年5月，南农大农业健康研究中心成立，该研究中心依托南京农业大学前沿交叉研究院运行。2024年6月15日，南京农业大学成立国家安全与国防教育中心。

截至2024年5月，学校设有20个学院（部），开设74个本科专业。

截至2024年5月，学校有30个硕士授权一级学科、21种专业学位授予权、17个博士授权一级学科和17个博士后流动站；学校有一级学科国家重点学科4个，二级学科国家重点学科3个，国家重点培育学科1个，国家和省级教学团队7个。

2017年，教育部网站公布了第四轮全国一级学科评估结果。学校作物学、农业资源与环境、植物保护、农业经济管理、公共管理、食品科学与工程、园艺学等7个学科评估结果为A类（包括A+、A、A-三个档次），其中作物学、农业资源与环境、植物保护、农林经济管理4个学科获评A+，A+学科数并列全国高校第11位。

公共管理学科评估结果为A,食品科学与工程、园艺学评估结果为A-；畜牧学、兽医学、农业工程、水产学、图书情报与档案管理等5个学科评估结果为B类（包括B+、B、B-三个档次）；环境科学与工程、草学、风景园林学、工商管理等4个学科评估结果为C类（包括C+、C、C-三个档次）。

截至2024年5月，学校有教职员工2900余人，其中中国工程院院士4名，国家杰出青年科学基金获得者等47人次，国家级教学名师3人，全国优秀教师、模范教师、教育系统先进工作者5人，入选国家其他各类人才工程和人才计划150余人次，国家基金委创新研究群体2个。

截至2024年5月，南京农业大学有国家级实验教学示范中心3个，1个省级虚拟仿真共享实验平台，15个省级实验教学与实践教育中心，4个校级实验教学示范中心。

截至2024年5月，学校共15门课程入选第二批国家级本科一流课程，其中线上一流课程2门、虚拟仿真实验教学一流课程2门，线上线下混合式一流课程3门、线下一流课程7门、社会实践一流课程1门。学校累计获批45门国家级一流本科课程，39门江苏省一流本科课程。

2022年，南京农业大学获国家级教学成果奖二等奖2项。

截至2024年5月，学校对外交流日趋活跃，先后与50多个国家和地区的170多所境外高水平大学、研究机构保持着学生联合培养、学术交流和科研合作关系。与美国加州大学戴维斯分校、康奈尔大学、比利时根特大学、新西兰梅西大学等世界知名高校，开展“交流访学”“本科双学位”“本硕双学位”等数十个赴境外长短期交流项目。

2007年，成为教育部“接受中国政府奖学金来华留学生院校”。2008年，成为全国首批“教育援外基地”。2012年，获批建设全球首个农业特色孔子学院。同年倡议发起设立“世界农业奖”，已连续九届分别向来自康奈尔大学、加州大学戴维斯分校、俄亥俄州立大学、波恩大学、阿尔伯塔大学、比利时根特大学、加纳大学、智利天主教大学、中国农业大学和默克莱大学等高校的12位获奖者颁发奖项。

2014年，学校获外交部、教育部联合批准成立“中国-东盟教育培训中心”。2019年经教育部批准与美国密西根州立大学合作设立南京农业大学密西根学院。建有“中美食品安全与质量联合研究中心”“中国-肯尼亚作物分子生物学‘一带一路’联合实验室”“动物健康与食品安全国际合作联合实验室”、“动物消化道营养国际联合研究中心”“中英植物表型组学联合研究中心”“南京农业大学-加州大学戴维斯分校全球健康联合研究中心”“亚洲农业研究中心”等多个国际合作平台。2021年12月牵头成立“中国-中东欧高校联合会农业与生命科学合作共同体”。

截至2024年5月，学校建有216个功能实验室，有作物遗传与种质创新利用全国重点实验室、肉品质量控制与新资源创制全国重点实验室、国家肉品质量安全控制工程技术研究中心、国家大豆生物育种产教融合创新平台、国家信息农业工程技术中心、国家大豆改良中心、国家有机类肥料工程技术研究中心、农村土地资源利用与整治国家地方联合工程研究中心、绿色农药创制与应用技术国家地方联合工程研究中心等114个国家及部省级科研平台。

学校“十二五”以来，学校到位科研经费90亿元，获得国家及部省级科技成果奖200余项，其中作为第一完成单位获得国家科学技术奖12项。主动服务国家脱贫攻坚、乡村振兴战略，凭借雄厚的科研实力，创造了巨大的经济社会效益，多次被评为“国家科教兴农先进单位”。四次入选教育部直属高校精准扶贫精准脱贫（精准帮扶）十大典型项目；连续四年获中央单位定点帮扶成效考核最高等级—“好”等级。

据学校图书馆官网信息显示，截至2024年5月，南京农业大学图书馆图书馆总建筑面积3.24万平方米。拥有阅览座位4516个，可供阅览的馆藏纸质书刊2460420册，图书馆建有1902信息共享空间、单人耘诗书画展览室、多媒体学习室等服务设施，每周开放101小时，年接待读者254余万人次，年纸本流通总量约8万册。图书流通采用汇文文献信息服务系统，并与校园一卡通系统接轨，读者可使用校园卡在馆内通过门禁、接受服务、自助缴费、自助充值等。

截至2024年5月学校图书馆官网信息显示，学校有电子图书5225840册，电子期刊4025029册，电子学位论文1302929册。自建特色数据库3个。

图书馆与南京航空航天大学图书馆、南京理工大学图书馆、南京林业大学图书馆、南京体育学院图书馆共同建设成立了南京城东高校图书馆联合体，通过统一的图书资源检索平台，实现了纸本图书通借通还，电子图书共知共享。

校徽

南京农业大学校徽主体造型采用同心圆环图形，似充满动感的车轮，寓意着学校滚滚向前的发展态势，象征全校师生员工凝心聚力、追求卓越的坚定信念和团结、勤奋、求实、创新的校风。两圆环之间上半部分为学校中文手书体名称 （费新我题写），下半部分为英文校名“NANJING AGRICULTURAL UNIVERSITY”，标识内心设计以大写的英文校名简称（NAU）变形组合成学校的标志性建筑“主楼”的造型图案，其下方为学校办学起始年份“1902”，其外部采用两株交叉联结的成熟麦穗向上环抱，象征学校的发展系建立在原中央大学农学院和金陵大学农学院两个重要前身及众多先辈们奋斗成果的基础之上，构图简洁，尊重历史，彰显了学校悠久的历史文化底蕴和以农科为优势的办学特色，寓意着学校人才培养、科学研究和服务社会等各项事业不断取得累累硕果。

校徽采用三色设计，其中，标识内心“主楼”造型图案的色彩处理采用深绿色，色标为C：80/M：0/Y：100/K：0，象征南京农业大学蓬勃的发展生机和活力，也与学校“绿色校园”的办学特色相吻合；两株麦穗以金黄色为主基调，并自上往下渐变加深，色标为C：10/M：10/Y：80/K：0~C：30/M：50/Y：60/K：40，象征学校在发展中国高等教育事业上取得累累硕果，也与学校农科优势的历史地位相吻合；同心圆形轮廓以蓝色为主基调，色标为C：100/M：80/Y：0/K：0，蓝白相间，中英文对照明目清晰，标识内心“1902”也采用与圆环相同的蓝色，内外呼应，象征学校一百多年的发展历程就像蔚蓝的天空一样广阔灿烂，也与学校建设世界一流农业大学的战略目标相吻合。

校训

·诚、朴、勤、仁

校训分别从学校前身中央大学校训“诚朴雄伟”和金陵大学校训“诚真勤仁”中各取二字组合而成，是学校在百余年办学历程中，秉承中央大学、金陵大学优良传统，逐步形成的具有南农特色的精神品格。

“诚”，诚恳、诚信。《礼记·中庸》有云：“诚者天之道也，诚之者人之道也。”“诚”是天的根本属性，努力求诚，以达到合乎诚的境界则是为人之道。以“诚”字为校训之首，意在训诫师生员工诚信做人，诚实做事。

“朴”，朴实、朴素，于质朴笃实中见才华，于朴素气质中见本性。《道德经》有云，“道常无名，朴虽小，天下不敢臣。”“朴”虽微细而无具体名象可称，但为宇宙万象之主宰。以“朴”为训，意在引导师生员工求真求善、质朴敦厚。

“勤”，勤奋、勤勉。书山有路勤为径，学海无涯苦作舟。业精于勤荒于嬉，行成于思毁于随。勤，体现了南农人勤奋刻苦、任劳任怨的精神品格，以“勤”为训，意在劝告师生员工勤敏担当、持之以恒。

“仁”，仁爱、仁义。《论语·雍也》有云，“夫仁者，己欲立而立人，已欲达而达人……己所不欲，勿施于人”，“仁”强调立己达人、相互关爱、尊重人格、与人为善。以“仁”为训，意在勉励师生员工心系苍生、仁爱天下。

校训“诚朴勤仁”要义即：诚信做人，诚实做事；求真求善、质朴敦厚；勤敏砺学、持之以恒；心系苍生、仁爱天下。

校歌

南京农业大学学生会是中共南京农业大学委员会和江苏省学生联合会共同领导、学校团委指导的代表全校青年学生的群众性组织，为全国学联委员单位，江苏省学生联合会副主席单位。

南京农业大学学生会本着“全心全意为同学服务”的宗旨，秉持着“崇尚理想者请进，追逐名利者莫入”的理念，坚持学生会是同学利益的代表，围绕学校党政中心，做好学校联系学生的桥梁和纽带，以引领大学生思想、维护学生权益、繁荣校园文化、提高学生综合能力为重点开展各项工作。

南京农业大学学生会下设综合事务中心、宣传教育中心、权益维护中心、文化艺术中心、体育文化中心五大职能中心，各中心接受学生会主席团的直接领导。

日语协会是由南京农业大学外国语学院社团联合会指导的院级社团，指导老师为外国语学院辅导员甄亚乐老师，有社长、副社长各一人，大一干事六人，正式社员共24人。日语协会以“‘语’中带乐，和而不同”为宗旨，负责承办与日本文化交流、日语学习相关的活动，力求通过每一次的社团活动培养同学们对于日语学习的兴趣，让活动参与者对中日文化更加了解。此外，日语协会还负责两位日语系外教老师的沟通与联系工作。

卫岗校区占地约915亩，其中校园用地为705亩，家属区约80亩，卫岗校区牌楼实验实习基地约130亩；各类校舍49.76万㎡，是学校目前办学的主校区，容纳全日制在校生20000余名。

浦口校区占地713亩，其中校园用地523亩，家属区40亩，校内不可利用山体150余亩；各类校舍14.32万平方米，容纳全日制在校生6000余名。

滨江校区位于南京江北新区长江之滨，与浦口校区同处长江北岸，与“卫岗”相呼应，形成南农“依山傍水”办学格局。滨，水边或近水的区域，亦指“靠近”；江，多专指长江；滨江校区濒临长江，其命名与自然地理风貌浑然天成，校区1号门（礼仪门）外为滨江大道，其命名与行政区域定位一脉相承。

南京农业大学白马教学科研基地位于江苏南京白马国家农业科技园科技创新核心区，占地面积5050亩，总建筑面积15.20万平方米，计划总投资8.22亿元，2010年4月获得教育部批准立项建设。基地空间根据单元结构和性质划分为五类功能各异又相互联系的主要区域：专业科教区（东、西两区）2665亩、创新与创业区742亩、中心展示区847亩（含中心湖）、教学生活区514亩、公共管理与服务区282亩。

在南京农业大学家属区，坐落着一座四柱三间冲天式的牌坊，中间略高，两侧略低。牌坊是典型的中式风格，给人“至若春和景明”的明媚与亲切感。据考证，这个牌坊是国民革命军遗族学校女子学校南大门。

“桃李不言，下自成蹊”，桃李廊位于勤仁坡的南侧，也由周永生老师设计。廊上东西两端的楹联是单人耘先生创作并书写，东面一幅是行书“酌古斟今参造化，耕烟犁雨播春风”，西面一幅是隶书，摘自朱熹诗句“旧学商量加邃密，新知培养转深沉”。值得一提的是，桃李廊的牌匾是金善宝老教授百岁时亲手所书。

在戮力同心卫岗校区中央路和金陵路的丁字路口中心，伫立着一座形似后母戊鼎（又称司母戊鼎）的大鼎。后母戊封印着商代密码与故事，而这座鼎则承载着南农的历史与发展。这座鼎是2002年江苏省人民政府赠送给学校的礼物，祝贺江苏9所同源高校100年发展卓有成就。也是鼓励这9所高校勠力同心，为国家再创辉煌。

在卫岗校区南苑学生生活区的校友山上，报春亭已经屹立了多年。1993年，为庆祝次年举办的80周年校庆，1972级农学系6个班级140名同学决定筹资建立一座“报春亭”，撷“谁言寸草心，报得三春晖”之意，表达对母校及老师辛勤培育的报答之情。基建处周永生老师接到了同学们的请求，表示非常乐意帮忙设计。同年年底，由周老师设计的报春亭在校友山竣工。 攒尖六角飞檐顶，取势飞扬、引人向上。黑瓦红柱，柱间有美人靠椅，青石铺地。报春亭的字句颇为讲究，匾额“报春亭”三字为淮阴师范学院美术系姜华先生所书。“飞扬四海凌云志，诚献珊瑚报瑞枝”“尔曹俱是丹青手，我辈能无社稷心”楹联二副取自单人耘先生的诗句，由2001届国际贸易专业校友梁治国书写。

在百余年的办学历程中，学校秉承以“诚朴勤仁”为核心的南农精神，培养具有“世界眼光、中国情怀、南农品质”的拔尖创新型和复合应用型人才，先后造就包括62位院士在内的30余万名人才。