1975年马、新《南洋商报》正式分家，改组后的马来西亚《南洋商报》经由马来西亚公民所控制，而成为本地化的报章。

1979年6月30日，《南洋商报》编排方式大改革，将传统华文报的直排改为横排，与中国的报业形式相似体。

1983年3月16日，新加坡《南洋商报》和《星洲日报》合并成为《联合早报》和《联合晚报》，新加坡中文报业从此成为一言堂。

1989年4月17日上市，成为马来西亚第一家在吉隆坡股票交易所挂牌的华文报。

南洋商报于1993年收购《中国报》。1993年1月，南洋报社收购中国报和生活出版社有限公司的全部股权，有6份报刊。《南洋商报》称读者人数1百50万人，占马来西亚华文报刊读者总人数的60%，成为马来西亚最大的华文出版集团。

1996年11月，《南洋商报》进入互联网领域，在网络上开办网站。

1997年10月4日推出新网址，成为马来西亚第一家在网上提供现时新闻（Real Time News）的报纸。

2000年6月，成立南洋线上有限公司。

2001年5月28日，华仁控股收购南洋控股并持有42%股份。华仁（HUAREN）管理私人有限公司――华仁控股，从丰隆集团手中收购南洋报业控股，献议以72.35%股权收购南洋商报，交易成交价为现金2亿3千12万4千961零吉，或每股5.50零吉。华仁成功控制马来西亚两大中文报――《南洋商报》、中国报，标志着在马来西亚原本相对独立的中文报章， 开始被执政政党介入。星洲日报、光明日报另两大报的拥有人更从华仁控股手中购得部分股权，之后的高层调动更显示星洲报业集团开始干预南洋、中国两报的业务，马来西亚四大家中文报从此被单一商业集团垄断。

2005年6月，南洋商报联合皇帽啤酒举办南洋十大义演并成功为华教筹获2亿4千万。

2006年10月6日，拥有83年历史的《南洋商报》宣布改版，以新面貌面对读者和市场。改版后的《南洋商报》以电脑字取代原本由著名书法家，南洋大学秘书长潘受书写的报头。《南洋商报》改版以崭新面貌面对读者，面对市场，它采用的“双封面头版”，在马来西亚报界开创了先河。彻底革新的《南洋商报》以“透彻、在线、互动”为主旨：透彻是指无论是社会、政治、财经、教育、体育或娱乐新闻与专题，都要做到深入透彻的采访和报道；在线是指《南洋商报》要与该报网站“南洋在线”以及短讯新闻密切配合，网络与报纸既相互竞争，又相辅相成；互动是指该报将举办各种活动，加强与读者的交流和对话，多倾听读者的心声。

许多《南洋商报》老读者无可奈何接受了这场改变，但是，新的报头也抹除了人们的历史记忆。2006年10月17日，星洲媒体执行主席丹斯里张晓卿买下南洋报业20.02股权，直接或间接控制44.76股权，崛起成为南洋报业最大股东。事后遭到部分人反对，认为马来西亚华文报业遭到张晓卿垄断（旗下大马报业包括《星洲日报》，《南洋商报》，《光明日报》与《中国报》）。

《东方日报》东主启德行集团董事长刘瑞源在11月6日向张晓卿献意收购南洋报业股权，并承诺将把有关的股权分割给华社。这项新闻却得到《南洋商报》高层职员不断的炮轰。《南洋商报》副总编辑何财福在“互动部落格”质疑刘瑞源的收购诚意、《南洋商报》助理新闻编辑邓丽华今日也在“互动部落格”指责刘瑞源献购南洋是一场荒谬、没有诚意的闹剧，并且怀疑有关献购目的是为了“带入个人仇恨、摧毁南洋”。

社长

南洋商报历任编辑部负责人（二战前称编辑主任，后必称为总编辑）

1962年8月起，《南洋商报》马来亚版在吉隆坡编印，1965年马来西亚和新加坡分家，南洋商报亦一分为二。1983年3月15日新加坡《南洋商报》与《星洲日报》合并为《联合早报》。

马来西亚《南洋商报》编辑部负责人：

栏目有奏议、文牍、纪事、瀛海琐闻、诗选、词选、小说。刊登文章有《农工商部奏请就产茶省分设立茶务讲习》、《江宁商务总会第一次联合大会纪事》、《麻风有救》、《华侨琐闻》、《雨三首之二》、《登金山江天寺楼》等。

《南洋商报》是《南洋商务报》的改良报纸。《南洋商报》改良的原因在于：“……本报是人民言论的机关，对于赛会立宪两事，是应该打起精神来……在下说南洋赛会，是本报报道的直接的主动力。中国立宪，是本报间接的主动力。本报若不改良，是本报放弃了报馆的天职。……要知道，本报对于商界，却算主位，却算原动力……本报代担责任，应该灌输些商界文明，增进商界幸福……现在总想换个新样儿，把商群联络的完全，显出本报的手段。把商法讨论的完全，显出本报的心思。把商学研究的完全，显出本报的根底。把商智开通的完全，显出本报的机关。把商权竞争的完全，显出本报的胆量。把商品审查的完全，显出本报的精神。……凡从前改良不完全的，这回不惜工本，推陈出新……不像从前南洋商界的腐败样儿，那本报就收了效果。”