最古的朱印状是今川氏亲在永正9年 (1512年)免除西光寺的栋别钱(房屋税)而发给的文书。以后，印判状这个制度在织田氏、武田氏、上杉氏、北条氏、里见氏等东国的有力战国大名被使用了。印判状多用于民政、军事方面的公文书发给，比起原来的花押署记要节省时间。

朱印、黑印在各大名家使用状况不同。织田信长也在公文书上用了黑印和朱印，外交文书等重要文书则用“天下布武”4字的朱印，黑印也有使用。豊臣秀吉则只使用朱印。徳川家康更进一步将朱印分为楕圆形和四角形的朱印。在许可海外贸易的时候，盖上后者的朱印，持有这个朱印状贸易的船被称为朱印船。