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正统三年（1438），以礼经中举人。正统四年（1439）进士。正统八年（1443），授吏科给事中。
正统十二年（1447），丁外艰归，起复，首言福建银场额重，民不堪。林聪恐生变，请轻之。时弗能用，已果大乱。及是复极言其害，竟得减免。
正统十四年（1449），土木堡之变爆发，林聪侃侃在职，知无不言，弹劾光禄卿柰享、太监王振家童张伯通奸状，又弹劾总兵杨洪、孙镗不合状。
景泰元年（1450），进都给事中。此时发生多方变故，林聪慷慨论事，无所避讳。中官金英的家人犯法，都御史陈镒、王文治罪，不给金英定罪。林聪率同僚弹劾陈镒、王文畏势从奸，涉及御史宋瑮，谢琚，皆下狱。不久复职。林聪又言宋瑮、谢琚不任风纪，二人调离外任。中官单增（一作善增）总督京营，有宠于上，朝士稍忤者则被侮辱；家奴白昼杀人，夺民产，侵商税。林聪告发其奸，下诏狱。得到赦宥后，单增不敢放肆。林聪又弹劾深受宠信的驸马石璟。
廷议迎回明英宗，有人说“虏人变诈不测，遣一车二马往迎，足矣”。林聪说：“上皇北征，为宗社计也。迎复礼宜从厚”。胡濙从袖子里拿出一张纸出示给林聪和叶盛，说：“此小人朴质之言，大抵皆欲迎复从厚者，吾欲以进如何”。王直闻言说：“此礼失而求之，野然于此，可验人心”，于是赞同他的意见。
景泰三年（1452）春，疏言：“臣职在纠察刑狱。妖僧赵才兴之远亲百口，律不当坐，而抄提至京。叛人王英，兄不知情，家口律不当逮，而俱配流所。虽终见原，然其始受害已不堪矣。湖广巡抚蔡锡弹劾副使邢端，为邢端所揭发，系狱经年，而邢端居职如故。侍郎刘琏督饷侵隐，不为无罪。较沈固、周忱乾没万计，孰为轻重？刘琏下狱追征，而沈固、周忱不问。犯人徐南与子中书舍人徐颐，俱坐王振的同党当斩，乃论徐南大辟，徐颐除名。皆刑罚之失平者。”景泰帝同意了林聪的上书。邢端下狱，刘琏得释，徐南亦减死，除名。
东宫易储，林聪有异论，涕泪，不署名，迁右春坊司直郎。景泰四年（1453）春，学士商辂言林聪敢言，不宜置之散地，乃复为吏科都给事中，仍食六品俸。上言夺情非令典，请永除其令。景泰帝纳之。
景泰五年（1454）三月，以灾异偕同官条上八事，杂引五行诸书，累数千言。大略以绝玩好，谨嗜欲，为崇德之本。而修人事，在进贤退奸。武清侯石亨、指挥郑伦身享厚禄，而多奏求田地；百户唐兴多至一千二百余顷，宜为限制。余如罢斋醮、汰僧道，慎刑狱，禁私役军士，省轮班工匠，皆深中时弊。景泰帝多采纳。
起初，吏部尚书何文渊因林聪言下狱，致仕去。吏部任命副使罗箎为按察使，参政李辂、佥事陈永为布政使。林聪疏争之，并言山西布政使王瑛老，宜罢官。罗箎等仍任故官，王瑛致仕。御史白仲贤以年资，擢广东按察使。林聪言白仲贤追逐名利，不当超擢，乃迁镇江知府。兵部主事吴诚因攀附而升职吏部，林聪弹劾之，遂改工部。诸司忌惮林聪风裁，林聪所言，无敢不奉行者，吏部尤甚。内阁及诸御史都认为林聪喜好建议而不友善。
其年冬，林聪的外甥陈和为教官，欲得近地便养。林聪为言于吏部。御史黄溥等于是弹劾林聪挟制吏部；从前弹劾白仲贤为徇私其乡人参政方员，欲夺白仲贤官予之；与吴诚有怨而弹劾吴诚；福建参政许仕达嘱托林聪求进，林聪推荐徐仕达堪任巡抚。并劾吏部尚书王直逢迎林聪。章下廷讯，坐专擅选法，论斩。高谷、胡濙力救。景泰帝知道林聪的为人，止贬国子监学正。
明英宗复辟，超拜左佥都御史，出使赈灾山东，活饥民百四十五万。还京后，进右副都御史，捕江、淮盐盗。以便宜，擒戮渠魁数人，余悉解散，而奏籍指挥之受盗赂者。
天顺四年（1460），曹钦造反。将士妄杀，至割乞儿首报功，市人不敢出户。林聪署院事，急令获贼者必生致，滥杀为止。锦衣卫官校厌恶曹钦杀指挥逯杲，悉捕曹钦姻识。千户龚遂荣及外舅贺三亦在其中。人知其冤，莫敢直，林聪辨出之。其他洗冤者甚众。
天顺七年（1463）冬，以刑部囚自缢，诸给事中弹劾纪纲废弛，与都御史李宾俱下狱。不久释放。
成化二年（1466），淮南、北发生饥荒，林聪外出巡视。奏贷漕粮及江南余粮以振，民德之如山东。次年，偕户部尚书马昂清理京军，进右都御史。
成化八年（1472），以故官起掌南京都察院兼提督巡江。前掌院多不乐御史言事，林聪独奖励之。有人责怪林聪，林聪曰：“己既不言，又禁他人言，可乎？”
成化十三年（1477）秋，召拜刑部尚书，寻加太子少保。林聪以旧德召用，持大体，秉公论，不严而肃，时望益峻。
成化十五年（1479），偕中官汪直、定西侯蒋琬按查辽东失事状。汪直包庇巡抚陈钺，林聪不能争，论者惜焉。
成化十八年（1482）八月，以疾休假，明宪宗遣医视疾，赐白粲、嘉蔬、羊酒，命稍微休息后即复出视事。闰月二十四日，卒于位，年六十八。明宪宗遣中官视丧事，赐钞万缗，赠荣禄大夫、少保，谥庄敏。又命礼部尚书周洪谟赐祭。
《明史》：①聪为谏官，严重不可犯。实恂恂和易，不为崭绝之行。以故不肖者畏之，而贤者多乐就焉。景泰时，士大夫激昂论事，朝多直臣，率聪与叶盛为之倡。②天顺、成化间，六部最称得人。王翱等正直刚方，皆所谓名德老成人也。观翱与李秉、年富之任封疆，王竑之击奸党、活饥民，王复之筹边备，姚夔之典秩宗，林聪、叶盛之居言路，所表见，皆自卓卓。
彭华：决狱不琐屑，善委任，遇大事，则反覆核躬自笔削，属官咸心服。