列岛多为花岗岩组成的丘陵地貌，现代沉积只见于小湟谷与海滩。

港湾较发育，有鹊石湾、白沙澳、马祖澳、曲蹄澳等。马祖列岛有鹊石湾、后澳等。这些海湾、港、澳多数水道较深，潮汐落差大，近海滩地开阔，湾内风小浪弱，锚地良好。

属亚热带海洋性气候，全年无霜，平均温度在10～27摄氏度之间，年降水量1100毫米，地下水源有限。

属中亚热带季风气候区域。雨量充沛，日照充足，夏长冬短，四季分明。

春季：候温在10～22℃间。气候开始回升，受冷暖气团交绥影响气温变化大，常出现连续性降水。　　夏季：候温在22℃以上。前期受暖湿气团影响，出现梅雨天气；后期受单一副热带高压控制，晴热少雨，常受台风影响，出现狂风、暴雨。　　秋季：候温与春季同。但降雨较少，秋高气爽，冷空气南下时，降温明显。　　冬季：候温小于10℃。盛行偏北气流，天气干冷，降温强烈，时有大风。　　境内候温受地貌地形制约，四季之初、终日及持续天数各异。

雨量分布，马祖地区为1048.2毫米。全年雨季、干季分明。3～6月冷暖气流互相进退消长，形成锋面降水，雨区广、雨量多、雨期长，形成雨季。一般占全年降水量一半。7～9月受副热带高气压控制，降雨不稳定，有台风或东波影响时，常有暴雨；无台风时，则持续晴旱。10月至翌年2月为蒙古高压所盘踞，天气持久晴寒，雨量少，形成干季。

由于基岩裸露，植被不发育，河沟短浅，汇水条件差，雨后地面径流大部直泄入海，地下水甚贫乏，以构成裂隙为主，泉水出露较少，流量少。常见值为0.05升/秒，单孔涌水量1.56～5.53吨/日。

连江解放前设竿塘乡，1949年后为台湾当局占据，分马祖、北竿、东引3乡、19村(另白犬列岛设1乡5村)。岛民以渔为主，通行福州话。岛上居民1949年1344户、5062人。1971年最高为17088人，后陆续外迁，1990年为5679人。

竿塘乡，包括马祖列岛的南竿、北竿、高登等岛和东涌、西涌岛。位于县境东南和东部海疆，雄峙闽江口，与黄岐半岛一衣带水，最近点仅隔9.25公里。据《福建通志》载，南竿岛古代属闽县。北竿岛属连江县，唐宋归永福乡崇德里，元至清属二十六都。时岛上居民不多，且因交通等条件限制，官府未设行政机构，只有军事设防。岛上常有匪盗啸聚，岛民受害不浅。明代后迁岛居民渐多，自成村落。明嘉靖间，倭寇横行，官府在岛上设哨防患，建烟墩报警。清初郑成功收复台湾后，常以马祖列岛为反清复明活动基地，清廷因此于顺治十八年(1661年)厉行海禁和迁界，岛民被迫迁徙连江县城近郊，到康熙十九年(1680年)才复界回迁。

民国时期南北竿和西洋均属连江管辖，初属第八区，设南竿、北竿、西洋3乡。1935年编查保甲，连江县政府派员赴岛编查，初设竿(塘)西(洋)联保，不久分设竿塘、西洋2个联保，属第三区署。1936年12月12日，东涌岛划归连江，编入西洋联保。1937年7月7日抗战爆发后，日本侵略军于同年9月10日侵占南北竿塘等岛。1939年秋，林义和抢走竿塘警备队枪支10多枝为匪，并与日军厦门“兴亚院”挂钩，任伪“和平救国军”第二集团军第一路司令，长期占据马祖列岛。抗战胜利后，重新编设竿塘乡和西洋乡。竿塘乡辖7保74甲：马祖保12甲、牛角保10甲、桥仔保10甲、津铁保11甲、山垅保10甲、白镜保11甲、塘岐保10甲。西洋乡辖6保67甲，其中东涌保7甲。

1949年8月16日连江解放后，马祖列岛和西洋、东涌等岛被台湾当局所盘踞。1953年西洋岛解放后划属霞浦县辖。

闽浙总督告示碑，在北竿岛塘岐村和桥仔村各竖一块相同的“闽浙总督告示”碑。据马祖有关志书记载，该碑系花岗石刻制，高217厘米、宽73厘米，立碑时间为清同治八年(1869年)。因长期露天受风雨侵蚀，部分字迹已模糊不清。全文约500余字，大意是清廷规定沿海渔业用盐分配和经营办法，以防盐帮纠纷。

东犬大埔碑刻，碑刻在东犬岛老山头悬崖上，为一方形岩刻，史称“大埔石刻”。据林金炎《马祖列岛记》载，1953年驻该岛马祖守军修工事时发现。为明工部右侍郎董应举(琯头镇塘头人)所题，全文41字，每字径22厘米。记载沈有容生擒倭兵69名事迹。碑刻时间为明万历四十五年(1617年)五月十五日(碑文详见《附录》)。

牛角峥嵘，位于南竿岛，旧称牛角澳，形似犀牛，牛首在东部牛角村，牛角岭陡峭险峻，怪石峥嵘，山崖奇崎，角状若裘，面临风口，冬季北风直灌，呼吸有声，堪称一绝。

西尾夕照，位于南竿岛西部尖端，隔海与大陆相望，房舍三五聚居，类北方风貌。每当夕阳西沉，暮云归舫，渔舟点点，与夕照相互掩映，疏影横斜，美景天成，缓步远眺，气象万千，悠然忘我，如置仙境。

珠螺鼓浪，位于南竿岛，濒临海滨，岩石遍布，形状各殊。每届涨潮，海浪拍岸，忽徐忽急，时若万马奔腾，气势磅礴；时似暮鼓晨钟，悦耳有致，天籁自然，足聘怀悦目，极视听之娱。

山垅映月，位于南竿岛山垅村，三面环山，胜景奇特。皎洁月夜融天光、海色、山岚、月影、渔村五位于一体，如银针泻地，珠落玉盘，给人以无限遐思与浪漫的温馨。

塘后滩景，位于北竿岛塘岐与后澳之间海滩。沙粒晶莹洁白，纤细光润，绵亘数百米，阔大恢宏。在晨曦或夕霞照耀下，白沙碧海，相映成辉。遇星月皎洁之夜，犹银盘铺地，漫步沙滩，苍苍茫茫，涛声海韵，心旷神怡。

北竿狮岭，位于北竿岛，岗阜酷似雄峙海上的雄狮，昂首挺立，气势非凡。四周岛礁串串，波光粼粼，帆船片片，群鸥翱翔。远眺海天连接，台湾海峡风云变幻尽收眼底，构成一幅如诗如画，如梦如幻的瑰丽画卷。

东引揽胜，东引岛山势挺峻，岩石崇伟，鬼斧神工，不经雕饰。尤以仙洞为最，因谷底与外海相通，巨浪激石，惊涛拍岸，回响不绝。岛上还有烈女义坑、骠悍亭诸胜及闽海关建造的英式东引灯塔，蒋介石视察东引题刻“其介如石”等胜迹。

按照现在的行政区划来说，马祖列岛隶属福建省福州市连江县，设为马祖乡。但因解放战争时期遗留的问题，马祖列岛被台湾当局控制，并且成立“连江县”管辖将这些岛屿，由此与大陆形成了两个连江县并存至今的情况。

台湾已经将马祖列岛的部分岛屿改了名字，例如马祖岛改为南竿岛，北竿塘岛改为北竿岛，并且下设了南竿乡、北竿乡、莒光乡和东引乡等4个乡镇来管理。

马祖列岛属亚热带海洋性气候，温差小，多大风。马祖列岛为岩岛，海岸陡峭，北竿塘西岸和南岸有沙滩发育。岛上耕地少，居民多以捕鱼为业，主要海产品有大黄鱼、鲳鱼、鳗鱼、丁香鱼等。 1999年，以马祖列岛为范围的马祖风景区成立，隶属于中国交通部管理。除了地形地貌和人文特色外，因为马祖地理位置关系，成为候鸟过境或渡冬的区域，2000年成立马祖列岛燕鸥保护区，主要针对白眉燕鸥、红燕鸥、苍燕鸥、凤头燕鸥、黑尾鸥、岩鹭、插尾雨燕等7种鸟类。2000年6月曾在此发现在世界鸟类红皮书中被列为临绝种的黑嘴端凤头燕鸥共4对，每年的最佳赏燕鸥季是5月到8月。

马祖通行的语言是“平话”、“马祖话”或福州话。

马祖列岛的开发最早始于元朝，是大陆渔民出海捕渔时休憩避风之所，明末清初期间当地为倭寇所盘据。到了清朝初期才又有福州沿海渔民移居此地，并逐渐形成具血缘关系的村落，其中以陈、林、曹、王、刘为大姓族群。今日南竿是马祖第一大岛和人口最集中地区，为连江县县治所在是马祖的政经文教中心。马祖地区的风土民情承袭于大陆福建闽东地区，当地语言为福州话（长乐口音居多），当地人多称为“平话”或“马祖话”。

马祖因四周环海又多风，当地居民多利用花岗岩块，沿着山坡地兴建，其结构多为方正双层独栋建筑，窗户小开于高处，窗棂以石条为骨架，屋脊为曲线造型如火焰燃烧般的“封火山墙”，屋顶以红或灰瓦覆盖并于接缝处压上石头，以防强烈海风吹刮侵袭。部分房屋受到南洋的欧式建筑影响，俗称“洋楼”或“蕃囝搭”。

后来，马祖进入近40馀年之战地政务与军事相关管制，所有皆划为军事重地。随处可见结构复杂的军事建筑、鬼斧神工的地下坑道及港口、据点、炮座、训练场所、军医院等军事设施，深具独特战地风光。自1992年11月7日起正式解除战地政务后，军方已陆续开放不同类型之军事观光资源，交由连江县政府与中国台湾地区“国家风景区管理处”经营供游客参访。

马祖列岛北起东引乡北岸（北纬26度23分）；南到莒光乡林拗屿南岸（北纬25度56分）；东到东引乡世尾山东岸（东经120度30分）；西至南竿乡津沙村西岸（东经119度51分）。与闽江口相距约54海里，离福建沿海约10多海里，距离台湾岛114海里、离金门岛152海里、澎湖180海里。列岛的陆域面积为29.52平方公里，全县各岛海岸线总长为133公里。地质条件上为花岗岩锥状岛屿，地势起伏大且陡峭。北竿岛的壁山标高294米，为马祖列岛第一高峰。南竿第一高峰是云台山，高248米，己列为台湾小百岳之一。

马祖列岛地形多谷地、湾澳，海岸地区花岗质岩石，受风化及波浪侵蚀作用，多崩崖、险礁、海蚀洞、海蚀门等地形，部分湾澳地区经过冲积与堆积作用形成沙滩、砾石滩、卵石滩。全县4乡只有东引没有沙滩。

马祖地区属亚热带海洋性气候，四季分明，冬冷潮湿，春夏交际多雾，秋天气候平均较为稳定。马祖的纬度略高于台湾北部（约一度），惟因靠近中国大陆的大陆型气候，气温比台北低，年平均温度为摄氏18．6度，早晚温差亦大，每年气温12月至2月间最低，3月份以后慢慢上升；7、8月气温最高，月平均温度在29度左右，此后逐渐下降，2月份月均温最低，仅10度左右。风速在10月至翌年3月间，大陆冷气团南下，有强烈东北季风吹袭，故风速最大；尤其是3至5月间，开始吹南风形成多云雾的天气，即为平流雾。

每年春天，南风从台湾海峡带来暖湿空气，和气温较低的马祖地面、水域接触，便形成浓雾。平流雾的厚度可达七、八百米以上，天气好时的日间太阳辐射最多只能消除云层顶部一部分，因此；如果平流雾历久不散，能见度骤降，这就是为何马祖地区的航班常常于此季节飞飞停停的原因。

马祖地区全年降雨量多集中于4至5月，台风则多发生于7、8月，年平均雨量约1060厘米，不到台湾岛雨量的一半，雨季集中在4至9月的梅雨季及台风季。

马祖列岛的美食和特产有清蒸黄鱼、淡菜、笔架、东莒光蛤、鱼面、黄金饺、萝卜丝饼、紫菜、继光饼、八八坑道高粱、东涌陈高、红糟、米醋、马祖酥、芙蓉酥、金银花茶等。

继光饼，相传中国明朝大将戚继光曾镇守于马祖清剿倭寇，为了能够在执行任务的时候还能填饱肚子，戚继光将军将圆型的面饼中间戳一个洞，让烤熟以后的面饼可以穿过绳子绑在腰间或胸口，方便将士们行军、执行任务时食用，因而得名。

麦葱，在马祖俗称野葱，这种野葱普遍生长于北竿乡的山坡地，每到冬、春两季，就是野葱生长的旺季，在怀道楼（以前的831）旁的山坡地、莒光堡旁的山坡地一带生长的最多最易摘采。

中国政府所辖马祖地区在解除战地政务以后，军事重地一一解禁成为民众观光的景点，而马祖列岛的多山、岩礁、岩岸地形，也造就了许多值得观光的美景，县政府特别针对观光这块市场进行推动马祖五岛四乡的观光资源。

塘后道沙滩

北竿乡最著名的景点，这座沙滩早年的时候是连接北竿岛塘岐村、后澳村的重要联外道路，每当涨潮的时候，海水会淹没塘后道沙滩，使得后澳村成为海外孤岛。现今的塘后道沙滩，为了两村联络方便，特别铺设了水泥道路，但这也使得原本塘后道沙滩涨潮就被淹没的特色消失；塘后道沙滩还有一个特点，南岸属于沙滩，北岸属于泥滩，同一个沙滩沙质有两种区别。

后澳村

后澳村大致仍属军事据点，以战争与和平纪念公园、螺蚌山自然生态步道为主；战争与和平纪念公园里面放了很多台湾早期在使用的军事器材，而在战争与和平纪念展览馆里面，则放有台湾早期使用的轻兵器、中国大陆心战文宣等装备。

芹壁村

被认为是北竿最美丽的村落，保存著大量古早海盗时期的石屋，由于居民大多数搬离，导致石屋欠缺人管理，以致损毁的损毁倾颓的倾颓，而在北竿乡公所的努力下，除了保留一些原始的石屋外，陆续修复受损的石屋并改建为民宿。

午沙村

介于上村、塘岐村之间，属于沙滩旁的小村落，在白沙港尚未启用之前，此处属于重要的军港，北竿乡的物资多半由此运进，但是在白沙港启用以后，午沙港渐渐失去重要性，解除战地政务后，作为战时掩蔽的午沙坑道也解禁，北竿乡公所正在架设内部的照明、通联等线路以开放给民众观光。

坂里村：坂里村界于坂山、里山之间，属于北竿乡难得的平原地形，此处出产的农业曾经供给北竿乡民大量的食物，而坂里村的特色就是拥有开阔的沙滩。

天后宫

马祖之名，即是由妈祖而来。相传妈祖生前入海营救父兄不幸罹难之遗体，即漂流至今南竿马祖村澳口处，千年来香火鼎盛，并分布于四乡五岛，为居民最主要之信仰中心。东莒

大浦聚落

大埔聚落保存著马祖算是最完整的石屋聚落，不但石屋保存的完整，早期渔民使用的渔网、居民的床铺、衣橱、厨具、都保有着古早的味道。

大浦石刻

清朝福建巡府董应台为了赞许驻守东莒光的沈有容不费一兵一卒智平60于名倭寇的事迹所刻的（国家三级古迹）。福正聚落

也算石屋保存完整的地方，但是建造风格、规模却是跟大埔聚落的大相廷迳，在福正聚落最重要的就是有百年历史的灯塔：东犬灯塔，此灯塔是从前洋人为了能保障通商行船的安全所建造，除了灯塔尚能发光以外，还保存著当年洋人办公的房舍、宿舍等等，正由莒光乡公所修缮并开放给民众参观。

东犬灯塔

东犬灯塔创建于1872年，东犬灯塔为台湾第一批采用花岗石建造的洋式灯塔，楼高四层，由塔身、塔灯及塔三部分组成，长年以来保存相当完好，其空间构造甚具特色，是研究清代洋式灯塔的重要实例。其塔座系由花岗石砌造，空心圆筒形平面，座身向上微收，内做螺旋石梯，盘旋直上。座顶叠涩出檐，上设工作平台，外围铸铁栏杆，塔顶安圆拱形铸铁灯罩以及圆标。东犬灯塔由地面至风标的总高为19.5米（64英尺）。其基地呈长方形，长约184米，宽约61.5米，面积约11316平方米。但1978年因战备需要，将西南角围墙拆除约50米，故面积约10549平方米。

东涌（东引）灯塔

公元1904年建成，由英国人设计、监造，塔高三层，由塔身、塔灯及塔顶等三部分组成。塔身由一米厚的红砖组成，塔灯为铸铁构造。灯塔面向台湾海峡，建在东引岛东北世尾山的悬崖之上，其造型及附属房舍均承袭十八世纪英式建筑的简洁、优雅风格，素有“东引别墅”之美名。

烈女义坑

传说，清朝末年，一渔人遭海盗杀害，渔人之妻不愿受辱，在此跳崖自杀，后人感念烈女殉节义举，乃命名为烈女义坑。山崖距海高达数十丈，气势奇伟，是拍照留念的最佳景点之一。

一线天

位于烈女义坑不远的军事据点，在两垂直相临的山崖中，军事坑道靠一座水泥桥相连，桥面距海面数十丈，气势慑人。旅客参观一线天之前，须先前往东引游客服务中心申请参观证，经卫兵陪同下，前往参观、拍照。由于一线天仍属重要军事基地，除非经由地方军事首长允许，一般旅客不可进入坑道内参观。